TCDB is operated by the Saier Lab Bioinformatics Group
« See all members of the family


1.B.40.1.2
Membrane anchored cell surface haemagglutinin (4726aas)

Accession Number:Q13U92
Protein Name:Haemagluttinin
Length:4726
Molecular Weight:454664.00
Species:Burkholderia xenovorans (strain LB400) [266265]
Location1 / Topology2 / Orientation3: Cell membrane1 / Multi-pass membrane protein2
Substrate Hemagglutnin

Cross database links:

RefSeq: YP_560399.1   
Entrez Gene ID: 4005825   
Pfam: PF05658    PF05662   
KEGG: bxe:Bxe_A0586   

Gene Ontology

GO:0019867 C:outer membrane
GO:0009405 P:pathogenesis

References (1)

[1] “Burkholderia xenovorans LB400 harbors a multi-replicon, 9.73-Mbp genome shaped for versatility.”  Chain P.S.G.et.al.   17030797

External Searches:

  • Search: DB with
  • BLAST ExPASy (Swiss Institute of Bioinformatics (SIB) BLAST)
  • CDD Search (Conserved Domain Database)
  • Search COGs (Clusters of Orthologous Groups of proteins)
  • 2° Structure (Network Protein Sequence Analysis)

Analyze:

Predict TMSs (Predict number of transmembrane segments)
Window Size: Angle:  
Window Size: Angle:  
FASTA formatted sequence
1:	MNKTYRSVWN ESTGTWVAAS EHASARGKKS SAKTSSTKAV VGALGLAAGL YGADAFALGG 
61:	GLTLCPTTEG SAGYTAGSAS SANGAYCGSD YQWGLFSNTN ADGSKSGQPI GAAIEGMNDG 
121:	SLLLYGPNNI VMKNLVSMSS NKIINLAPGT VSSTSADAVN GSQLYATNQN VSNIGNTVNN 
181:	ITTGAGIMYF HVNSTLADST ANGVNSIAIG GATRTDANNS ISIGTGLTQA SSNTGAIAIG 
241:	QNASINVYGA NSIAIGTNSA TGGIGGAIAL GENAFATGGK MLALGSGASA TTANSVALGS 
301:	GSTTTANLTA AGYNPGSGTL AGTSQATNGE VSVGNAGAER RITNVAAGSA ATDAVNVSQL 
361:	QSEDAKVNTI NNNVNNLSGS VTNISSTVNN ITNGGGIKYF HANSTQADSS ATGTDAVAIG 
421:	GNAQATAANS VALGLNSTSK GTNAIALGGA VAGGSYAFAA GSLALAATTG DIALGSSATA 
481:	SSANSNAYAT ALGTNALANA TDATAIGEGA SATAASSVAL GARSKTTANL STAGYNPGTG 
541:	TLSGTTPTGE VSVGSAGKER RVTNVAAGSA ATDAVNVSQL MSEDAKVNTI NNNVNNLSNN 
601:	VTNIAGNVTN ISNTVNNITN GGGIKYFHVN STLADSSAGG TNSIAIGGGA TTGNVTAGTS 
661:	DNISIGTNAT TNYGKNIAIG GNAQALGGAY DGGYNTAIGE NAIAKGDGAG GFGGGGWGQT 
721:	TAIGGGSQAL HDNTTAVGSG AIANVANATA LGMSASATAG SAIALGQGAV ASAANSVALG 
781:	SGSTTTANLS AAGYNPGTGT LSGIASVANG EVSVGAAGKE RRITNVAAGS AATDAVNVSQ 
841:	LQSEDAKVNT INNNVNNLSG SVTNISNTVN NITNGGGIKY FHTKSTLADS SATGTDAVAI 
901:	GGNAQATAAN SVALGSNSTT TANLSAAGYN PGTGALSGIA SAANGEVSVG AAGKERRITN 
961:	VAAGSAATDA VNVSQLQSED AKVNTISNNV NNLSGSVTNI SSTVNNITNG GGIKYFHTNS 
1021:	TLADSTANGV NSIAIGGATR TDANNSISIG TGLTQASSNT GAIAIGQNAS INVYGANSIA 
1081:	IGTNSATGGI GGAIALGENA FATGGKMLAL GSGASATTAN SVALGSGSTT TANLTAAGYN 
1141:	PGSGTLAGTS QATNGEVSVG NAGAERRITN VAAGSAATDA VNVSQLQSED AKVNTINNNV 
1201:	NNLSNNVTNI AGNVTNISNT VNNITNGGGI KYFHTKSTLA DSSATGTDAV AIGGNAQATA 
1261:	ANSVALGSNS TTTANLSAAG YNPGTGTLSG TTPTGEVSVG SAGKERRVTN VAAGSAATDA 
1321:	VNVSQLQSAI IGSTANAVAY DDGTKATVTL KGASGTKITN LTAGNLSATS TDAVNGSQLY 
1381:	ATNQNVSNIG NTVNNITNGG GIKYFHANST QADSSATGSN SVAVGDRASS LGGSSVAMGD 
1441:	GATAVGAASI AIGNNAQNVT GSNNSVAIGG DSKAGDRSVS LGNGADTSLS SWGVAVGTNA 
1501:	NVSAALGTAI GAGANVSGAN STAIGANAVA SATNSVALGS NSTTTANLSA AGYNPGTGTL 
1561:	SGIASAANGE VSVGAAGKER RVTNVAAGSA ATDAVNVSQL QSEDAKVNTI NNNVNNLSGS 
1621:	VTNISSTVNN ITNGSGIKYF HTNSTLADSS AGGANSIAIG GGAATSSSAG LSDNMAIGTN 
1681:	ATASYGKNIA IGGGAQATGG TYDGGYNVAL GENANATAGT NAWGHNTAIG ANTVINGVNS 
1741:	VALGISATTS GSGSMAFGSA AQASADYAIA SGAGANASAV NSVALGSNST TTANLSAAGY 
1801:	NPGTGTLSGI ASVANGEVSV GSAGKERRVT NVAAGSAATD AVNVSQLQSE DAKVNTINNN 
1861:	VNNLSNNVSN IAGNVTNISN TVNNITNGGG GIKYFHANST LADSSATGTD AVAIGGNAQA 
1921:	TAANSVALGS NSTTTANLSA AGYNPGTGTL SGTTPVGEVS VGSAGKERRV TNVAAGSAAT 
1981:	DAVNVSQLQS AIIGSTANAV AYDDGTKATV TLKGASGTKI TNLTAGNLSA TSTDAVNGSQ 
2041:	LYATNQNVSN VGNTVSNLSN NVTNIAGNVT NISNTVNNIT NGGGIKYFHA NSTLADSSAT 
2101:	GTDAVAIGGN AQATAANSVA LGSNSTTTAN LSAAGYNPGT GALSATTPVG EVSVGSAGKE 
2161:	RRVTNVAAGS AATDAVNVSQ LMSEDAKVNT INNNVNNLSN NVSNIAGNVT NISNTVNNIT 
2221:	NGGSGIKYFH ANSTLADSSA TGVDAVAIGG NAQATAANSV ALGSNSTTTA NLSAAGYNPG 
2281:	TGALSGIASA ANGEVSVGAA GKERRITNVA AGSAATDAVN VSQLQSEDAK VNTINNNVNN 
2341:	LSNNVSNIAG NVTNISNTVN NITNGGSGIK YFHANSTLAD SSATGTDAVA IGGNASASAA 
2401:	NSVALGSNST TTANLSAAGY NPGTGVLSGI ASAANGEVSV GAAGKERRIT NVAAGSAATD 
2461:	AVNVSQLMSE DAKVNTINNN VNNLSNNVTN IAGNVTNISN TVNNITNGGS GIKYFHANST 
2521:	LADSSATGTD AVAIGGNAQA TAANSVALGS NSTTTANLSA AGYNPGTAAL SGIASAANGE 
2581:	VSVGSAGKER RVTNVAAGSA ATDAVNVSQL QSEDAKVNTI NNNVNNLSNN VSNMAGNVTN 
2641:	ISNTVNNITN GGGGIKYFHA NSTLADSSAT GTDAVAIGGN ASASAANSVA LGSNSTTTAN 
2701:	LSAAGYNPGT GVLSGIASAA NGEVSVGAAG KERRITNVAA GSAATDAVNV SQLMSEDAKV 
2761:	NTINNNVNNL SNNVSNIAGN VTNISNTVNN ITNGGSGIKY FHANSTLADS SATGTDAVAI 
2821:	GGNAQATAAN SVALGSNSTT TANLSAAGYN PGTGTLSGTT PVGEVSVGSA GKERRVTNVA 
2881:	AGSAATDAVN VSQLQSAIIG STANAVAYDD GTKATVTLKG ASGTKITNLT AGNLSATSTD 
2941:	AVNGSQLYAT NQNVSNIDNT VSNLSNNVTN IAGNVTNISN TVNNITNGGS GIKYFHANST 
3001:	LADSSATGTD AVAIGGNASA SAANSVALGS NSTTTANLSA AGYNPGTGAL SGIASAANGE 
3061:	VSVGAAGKER RITNVAAGSA ATDAVNVSQL MSEDAKVNTI NNNVNNLSNN VSNIAGNVTN 
3121:	ISNTVNNITN GGSGIKYFHA NSTLADSSAT GVDAVAIGGN AQATAANSVA LGSNSTTTAN 
3181:	LSAAGYNPGT GALSGIASAA NGEVSVGAAG KERRITNVAA GSAATDAVNV SQLQSEDAKV 
3241:	NTINNNVNNL SNNVSNIAGN VTNISNTVNN ITNGGSGIKY FHANSTLADS SATGTDAVAI 
3301:	GGNASASAAN SVALGSNSTT TANLSAAGYN PGSAALSGTA SAANGEVSVG AAGKERRITN 
3361:	VAAGSAATDA VNVSQLQSED AKVNAEGAAT AAALGGGSTY NTTTGAITSP TYIAGGKTFN 
3421:	NVGDVVTNID GRVTQNSTDI TNLTTTIDNG TIGLVQQATP TSTITVAKDT GGATVDFRGT 
3481:	GNATRTLTGI TAGELSATST DAVNGSQLYA TNQNVSNIDN TVSNLSNNVT NIAGNVTNIS 
3541:	NTVNNITNGG GGIKYFHANS TLADSSATGV DAVAIGGNAQ ATAANSVALG SNSTTTANLS 
3601:	AAGYNPGTGA LSGIASAANG EVSVGAAGKE RRITNVAAGS AATDAVNVSQ LQSEDAKVNT 
3661:	INNNVNNLSN NVSNIAGNVT NISNTVNNIT NGGSGIKYFH ANSTLADSSA TGTDAVAIGG 
3721:	NASASAANSV ALGSNSTTTA NLSAAGYNPG SAALSGTASA ANGEVSVGAA GKERRITNVA 
3781:	AGSAATDAVN VSQLQSEDAK VNAEGAATAA ALGGGSTYNT TTGAITSPTY IAGGKTFNNV 
3841:	GDVVTNIDGR VTQNSTDITN LTTTIDNGTI GLVQQATPTS TITVAKDTGG ATVDFRGTGN 
3901:	ATRTLTGITA GELSATSTDA VNGSQLYATN QNVSNIDNTV SNLSNNVTNI AGNVTNISNT 
3961:	VNNITNGGGG IKYFHANSTL ADSSATGVDA VAIGGNAQAT AANSVALGSN STTTANLSAA 
4021:	GYNPGTGTLS GIASAANGEV SVGAAGKERR VTNVAAGSAA TDAVNVSQLQ SEDAKVNTIN 
4081:	NNVNNLSNNV SNIAGNVTNI SNTVNNITNG GGGIKYFHAN STLADSSATG TNSLAAGPAA 
4141:	VASATDAVAL GNGAKATNAG AVALGAGSTT TTAVATSGTT IGGITYTFAG VAPSSTVSVG 
4201:	AAGSERTITN VAAGRLSATS TDAVNGSELF ATNQQVTRNT ADITNLTNNM NIGSVGLVQQ 
4261:	DATTRTITVA KATDGTRVDF TGTGGARQLT GVAAGAVNAT SVDAVNGSQL YGVSQSVADA 
4321:	IGGGSTVNTD GSISAPTYVV DGTTVHNAGD AISNLDNRVT QNTTDISTIN NTLNSITTGA 
4381:	GVKYVHVNST LADSLAKGAE SVAIGGNAQS QAANSVALGS NSVADRANTV SVGAAGAERQ 
4441:	ITNVAAGTAD TDAVNVAQLK ASGVINTDGT TNAAVTYDHN ADGSANYNSV TMGNGVAGGT 
4501:	TIHNVAAGSA ADDAVNVSQM NAAISSVSNI IGSAGNPLFT ADGNRDTEAA VASGTHATAM 
4561:	GANAKASAAN SVALGANSVA DRENTVSVGS AGNERQVTNV AAGTATTDAV NVGQLNQAIG 
4621:	ASIGNLPAGM SAKDYTDQQI NAVQNGVNQV AKNAYAGIAA ATALTMIPDV DQGKTIAVGV 
4681:	GGGSYKGSQA VALGISARIT QNLKMKAGAG TSSQGTTVGL GASYQW